O rubro negro piauiense foi fundado no dia 8 de dezembro de 1937 e, desde então, já venceu o Campeonato Piauiense por 17 vezes, o último deles conquistado em 2009.
Em participações na primeira divisão do Brasileiro, o Flamengo do Piauí esteve em 7 edições da Série A. Também disputou 4 vezes a Série B.
Na Copa do Brasil, foram 11 aparições. Sua campanha mais destacada foi na edição de 2001, quando chegou às oitavas de final, representando o melhor desempenho de um clube piauiense na história da competição.
A Federação de Futebol do Piauí parabeniza o Esporte Clube Flamengo pelos seus 85 anos de fundação.